在中国，发票丢失后使用记账联复印件抵扣进项税额的合法性存在一定争议，但根据现行税收法规和税务机关的实践，在满足特定条件下是允许的。以下是关键法律依据和操作要点：

一、法律依据

《国家税务总局关于增值税发票综合服务平台等事项的公告》（2020年第1号）

明确规定：纳税人丢失增值税专用发票的记账联或抵扣联，可凭相应联次的复印件（需加盖销售方发票专用章）作为抵扣、退税或记账凭证。

《中华人民共和国发票管理办法实施细则》（2019年修订）

第三十一条规定，丢失发票的纳税人需书面报告税务机关并登报声明作废，但实际操作中已简化（如部分地区取消登报要求）。

二、合法操作条件

需取得销售方配合

销售方需提供记账联复印件，并加盖发票专用章（公章无效）。 

复印件上应注明“此件与原件一致”及销售方联系方式。 

向税务机关报告

需在发现丢失当日或次日向主管税务机关书面报告（部分省市可通过电子税务局办理）。 

部分地区可能要求提供《丢失增值税专用发票已报税证明单》（由销售方税务机关开具）。 

抵扣流程

记账联复印件需通过增值税发票综合服务平台勾选认证，或经税务机关审核确认。 

三、争议点与风险提示

地方执行差异

部分基层税务机关可能对复印件效力持谨慎态度，建议提前与主管税务局沟通确认。 

真实性核查风险

若销售方涉嫌虚开发票，或复印件信息不完整（如无销售方签章），可能被认定为不合规凭证，导致进项税额转出、滞纳金甚至罚款。 

司法判例分歧

个别法院判例中，纳税人因未履行报告义务或无法证明交易真实性，被判不得抵扣（如(2019)京行终字第XX号案例）。 

四、建议操作步骤

立即联系销售方获取加盖发票专用章的记账联复印件。 

向税务机关报告（书面或电子渠道），留存回执。 

补充证明材料如合同、付款凭证、物流单据等，佐证交易真实性。 

咨询主管税务机关确认当地执行细则，避免程序瑕疵。 

五、替代方案

若销售方无法配合（如已注销），可凭其他证据链（如合同、付款记录、入库单等）向税务机关申请“税前扣除凭证”，但增值税抵扣可能受限。

总结：记账联复印件抵扣进项税在法规层面有效，但需严格遵循程序要求并确保交易真实。建议企业完善发票管理制度，避免丢失风险。如有争议，及时寻求专业税务律师或会计师协助。